Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX4Q06945 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX4Q06945 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms