Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms