Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms