Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms