Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms