Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms