Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPCAP84074 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPCAP84074 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms