Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42P60953 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms