Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms