Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NMUP48645 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NMUP48645 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NMUP48645 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NMUP48645 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NMUP48645 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NMUP48645 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms