Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms