Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5AP29375 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms