Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRHP20396 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRHP20396 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRHP20396 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRHP20396 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRHP20396 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRHP20396 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRHP20396 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRHP20396 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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