Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD46P15529 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms