Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODC1P11926 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODC1P11926 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms