Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPCP11686 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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