Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2AP11388 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms