Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms