Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPXO76031 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPXO76031 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPXO76031 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPXO76031 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPXO76031 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPXO76031 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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