Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIN3BO75182 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms