Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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