Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SURF4O15260 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms