Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms