Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA2E9PIF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms