Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRCP1A6NGW2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCP1A6NGW2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms