Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP1Q9Y3L3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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