Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms