Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms