Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms