Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms