Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL1Q9NSC2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms