Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms