Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms