Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F12Q9HCS2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms