Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms