Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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