Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms