Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTNAP4Q9C0A0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms