Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms