Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms