Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms