Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STAC3Q96MF2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms