Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms