Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms