Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms