Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms