Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM35BQ8NCS4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms