Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms