Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

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Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VWA5B2Q8N398 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms