Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms